Ülkemizde Hemşirelik, Ebelik ve Sağlık Memurluğu mesleklerinin lisans düzeyinde yapılmasını sağlamak amacıyla 1996 yılında Üniversitelere bağlı olarak kurulan 79 Sağlık Yüksekokulu arasında yer alan Manisa Sağlık Yüksekokulu, 1997 yılında faaliyete geçmiştir. 1997-1998 öğretim yılında Hemşirelik Bölümüne öğrenci kabul ederek eğitime başlayan Yüksekokul bünyesinde, Ebelik ve Sağlık Memurluğu Bölümleri de kurulmuş ve 1999-2000 Öğretim yılında Ebelik Bölümüne, 2000-2001 Öğretim yılından itibaren Sağlık Memurluğu Bölümüne öğrenci alınmıştır.
2 Mayıs 2007 tarih 26510 sayılı Resmi Gazete'de yayınlanan 5634 sayılı Hemşirelik Kanununda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun'un 7. Maddesine eklenen geçici Madde 2'ye bağlı olarak, Sağlık Memurluğu Bölümü kapatılarak hemşirelik bölümü ile birleştirilmiştir. 2007 yılından itibaren bu programa öğrenci kaydı yapılmamaktadır. 2011 yılında Yüksek Öğretim Kurulunun onayı ile Sosyal Hizmet ve Sağlık Kurumları İşletmeciliği Bölümleri açılmıştır. 2011-2012 Öğretim yılında Sosyal Hizmet Bölümüne, 2012-2013 Öğretim yılında Sağlık Kurumları İşletmeciliği Bölümüne öğrenci alınması planlanmaktadır.
Ayrıca Yüksekokulumuzun “Sağlık Bilimleri Fakültesi”ne dönüşüm çalışmaları devam etmektedir.
